Initiantin und Trägerin des Anna Göldi Museums ist die 2007 gegründete Anna Göldi Stiftung, die von der Standortgemeinde Glarus, dem Kanton Glarus, von Pro Helvetia, Gönnern und Sponsoren finanziell unterstützt wird.

Die von Dr. iur. Walter Hauser (1957– 2022) ins Leben gerufene Stiftung bezweckt die Wahrung des Gedenkens an die 1782 in Glarus hingerichtete Anna Göldi und den Prozess, der zu ihrer Verurteilung führte sowie die Erforschung der Hintergründe. Sie setzt sich zudem für die Wahrung der Menschen- und Grundrechte ein und engagiert sich gegen Diskriminierung, Rassismus und Willkür.

• Präsidentin: Veronika Britt, Rechtsanwältin / MAS Banking & Finance
• Vizepräsident: Peter Bertschinger, dipl. Ing. ETH
• Nicole Billeter, Dr. phil., Historikerin
• Ursula Helg, Dr. phil., Museumsleiterin 
• Susan Honegger, Sozialpädagogin / Künstlerin
• Helen Thomas, PhD, Senior Researcher ETH Zürich, Architektin, Autorin, Verlegerin
• Francesca Trento, Theologin und Journalistin

• Peter Bertschinger, dipl. Ing. ETH
• Peter Jenny, Prof. em. ETH Zürich
• Elisabeth Kopp (1936-2023), alt Bundesrätin